Субъектом защиты является прежде всего сама предпринимательская структура, противодействующая субъектам криминальной конкуренции, объединение деловых кругов, а также в определенных законом случаях — правоохранительные органы. Поддержку предпринимательства осуществляют в основном государство в лице высших органов законодательной и исполнительной властей, а также государственные органы экономического управления. Определенную роль здесь играют негосударственные организации, специализирующиеся на оказании поддержки, а также другие предпринимательские структуры.
Поддержка ориентирована прежде всего на малый и средний бизнес. Проблемы же обеспечения безопасности в равной степени актуальны как для малого, среднего, так и для крупного бизнеса.
Функции защиты предпринимательства в деятельности государственных органов в явном виде сейчас не выделены, поэтому неизбежно решение некоторых особенно острых задач защиты в рамках функции поддержки.
По признаку субъекта управления выделяют шесть уровней иерархии управления системой защиты предпринимательства: общегосударственный; ведомственный; региональный (муниципальный); объединений деловых кругов; предпринимательской структуры; индивидуального предпринимателя.